THE ANNUAL
BIOINFORMATICS MEETING OF ARGENTINA

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Herramientas Computacionales para la predicción de complejos proteína-ligando

Carga horaria:
- Teoría 2 horas
- Práctica 3 hs por la tarde (aprox. 15 a 18 hs)
Día 1: Clases teóricas asincrónicas (disponibles una semana antes del día 2)
Día 2: Clase práctica presencial en Corrientes el miércoles 23 de noviembre.

Docentes: Rafael Betanzos San Juan y Marcelo Daniel Gamarra. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (IQUIBICEN)- UBA

Contenido:

• Visualización de Biomoleculas: Manejo básico del programa VMD.
• Análisis de la estructura secundaria de proteínas.
• Análisis de las interacciones proteína-ligando.
• Introducción al Docking Molecular.
• Manejo básico del programa Autodock4.
• CADM: Conventional Autodock Docking Method.
• WSDBM: Water Sites Bias Docking Method.

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Expresión génica diferencial, un abordaje bioinformático

Carga horaria:
Día 1: Clases teóricas asincrónicas (disponibles una semana antes del día 2).
Día 2: Clase práctica presencial en Corrientes el miércoles 23 de noviembre, 3 hs por la mañana y 3 hs por la tarde (aprox. de 9:30 a 12:30 y luego de 14 a 17 aprox).

Docentes: Agustin Ariel Baricalla. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires (CIT NOBA) – CONICET

Contenido:

• Obtención de muestras y revisión de metodologías de secuenciación actuales..
• Calidad de los datos de secuenciación.
• Trimming de adaptadores y eliminación de secuencias de baja calidad.
• Ensamble transcriptómico de novo y calidad.
• Alineamiento a genoma o transcriptoma.
• Calidad de alineamiento.
• Cuantificación de la expresión génica.
• Expresión génica diferencial.
• Enriquecimiento de términos GO.

Se recomienda asistir al curso con una notebook con Linux. Sin embargo, a las personas que no lleven su computadora personal a la clase presencial, se les suministrará una.

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